По распоряжению Министерства культуры Азербайджанской ССР согласно указу № 502 от 26 сентября 1985 года было принято решение о создании Шушинского филиала Государственного музея ковра и народно-прикладного искусства с целью изучения, сохранения и поддержания древних традиций ковроткачества Карабаха.

Филиал начал свою деятельность 19 мая 1987 года в Шуше, в особняке Керим бека Мехмандарова (улица Кочарли, дом 17) – историко-архитектурном памятнике XVIII века. В Шушинском филиале демонстрировались тщательно отобранные в основном фонде Государственного музея ковра и народно-прикладного искусства, прекрасные произведения, дарованные человеческой культуре и воплощающие национальные и ремесленные ценности – карабахские ворсовые и безворсовые ковры, ковровые изделия, художественная вышивка, национальные костюмы, ювелирные украшения и художественный металл. Эти шедевры восхищали как туристов, прибывающих в Шушу, так и самих шушинцев.

Однако в 1992 году территория Карабаха была оккупирована нашими вероломными соседями по региону, и ценные произведения искусства, хранящиеся в филиале музея, оказались под угрозой.

29 февраля 1992 года была организована эвакуация предметов, хранящихся в филиале. Из 246 экспонатов, демонстрировавшихся в Шушинском филиале, в Баку было доставлено 183 (80 ворсовых ковров, 35 безворсовых ковров и ковровых изделий, 39 ювелирных изделий, 29 художественных вышивок и национальных костюмов). К сожалению, ввиду трудности транспортировки остальные 63 экспоната (56 медных, 6 ковровых изделий и одна художественная вышивка) вывезти так и не удалось.

Спасенные тогда экспонаты обрели пристанище в Государственном музее ковра и народно-прикладного искусства, ныне − Азербайджанском национальном музее ковра. Здесь они выставляются в экспозиции и хранятся в фонде.

В годы оккупации в особняке Мехмандаровых в Шуше, где находился Шушинский филиал музея, действовал краеведческий музей, основанный армянами. В этом музее национально-культурные артефакты азербайджанского народа были представлены миру как имеющие армянское происхождение.

В 2016 году был впервые издан каталог экспонатов, спасенных из Шушинского филиала. Он был подготовлен к годовщине оккупации Шуши директором Азербайджанского национального музея ковра, доктором философии в области искусствоведения Ширин Меликовой.

В течении последних лет была проведена серия выставок экспонатов историко-этнографических музеев оккупированных территорий и состоялись мероприятия с участием представителей общественности, приуроченные ко дню оккупации.

2020 год стал значимым и историческим для нашей страны и нашего народа. 8 ноября 2020 года колыбель азербайджанской культуры, сердце Карабаха, неотъемлемая часть нашей родины – Шуша была освобождена от оккупации. Так, одно из культурных мероприятий в освобожденной Шуше стала выставка «Снова в родном краю. Жемчужины искусства Карабаха» в Галерее ковроткачества в Шуше. На выставке, представленной Азербайджанским национальным музеем ковра при организационной поддержке Фонда Гейдара Алиева, экспонировались 32 экспоната – ворсовые и безворсовые ковры, ковровые изделия, национальная вышивка и костюмы, художественные образцы работы по металлу.

Сегодня экспонаты Шушинского филиала музея, охватывающие XIX–XX века, представлены традиционными карабахскими ворсовыми коврами с такими композициями, как «Шабалыд-бута», «Бахманлы», «Атлы-итли», «Ханлыг», «Челеби», «Ачма-юмма», «Малыбейли», широко распространенными в быту наших предков безворсовыми коврами − джеджимами, килимами, зили, шедде, образцами ювелирных изделий, художественной вышивкой и красочной карабахской одеждой.

За последние годы коллекция филиала пополнилась несколькими интересными экспонатами.

На ковре «Бахчада гюлляр», принадлежащем к Карабахской группе, имеется надпись: «1 января 1971 года подарок Сарвару в день рождения на память от матери». Данный ковер был выставлен на аукционе в Лос-Анджелесе (США) в феврале 2017 года под названием «Древняя Армения. Карабахский ковер». Гражданин Америки Эльшад Тахиров, этнический азербайджанец, приобрел этот ковер и стал разыскивать его первоначального владельца. Но владелец ковра так и не нашелся, и 5 мая 2017 года Эльшад Тахиров подарил ковер Азербайджанскому национальному музею ковра. Отметим, что это первый ковер, который, побывав в руках армянских оккупантов, спустя много лет вернулся на родину.

В 2020 году Министерство культуры Азербайджанской Республики подарило Шушинскому филиалу АНМК знаменитый ковер «Челеби» конца XVIII – начала XIX века, приобретенный на известной итальянской ковровой выставке «Сартирана». Серединное поле ковра представляет собой композицию с одним большим медальоном с шестнадцатью изрезанными по краям лепестками на темно-бордовом (сумахѝ) фоне и заполняющими элементами вокруг, носящими определенный смысл. Хотя эта медальонная композиция, принадлежащая древним тюркам, имеет разные значения, в основном она олицетворяет солнце. Основной бордюрный пояс, окружающий серединное поле ковра, заполнен орнаментом «зульфи-алем», широко распространенным в азербайджанском ковроткачестве. Остальные элементы в серединном поле ковра и в бордюре вносят в композицию особую гармонию с точки зрения цвета.

Сегодня Шушинский филиал продолжает свою работу в основном здании музея в ожидании того времени, когда будет завершено строительство его нового здания в Шуше, оборудованного по последнему слову современных технологий.